科研全能环境
41 个专用技能、30+ 权威公开数据源与一整套沙箱工具，开箱即用。技能声明可访问的域名，构建期校验、运行期白名单放行——没声明的，网络层直接拒绝。
专用技能 · 41 个
文献与知识
litreview
检索并汇总文献（OpenAlex + PubMed 双源），产出带引用的综述提纲。纯 API 工作流。
biorxiv
bioRxiv / medRxiv 预印本：按日期窗口列新预印本、查单篇全部版本、查已被期刊正式发表的预印本。
morning
科研日常简报：按关注主题汇总时间窗内新文献与数量对比图，也可汇总近期更新的临床试验。
reactome
Reactome 权威人工审编通路：按基因/关键词检索通路、取成员分子与层级结构、查基因参与列表。
regulation
转录调控数据：JASPAR 转录因子结合基序、ENCODE 功能基因组实验检索（TF ChIP-seq、ATAC-seq 等）。
resources
实验资源与经费检索：抗体注册库（300 万条抗体）、Grants.gov 联邦资助机会。
基因、基因组与变异
genes
基因标识符互转与功能本体：Ensembl、Entrez、UniProt、HGNC 全套 ID 与基因组位置，并查 GO 注释。
genomes
Ensembl 基因组查询：基因坐标与结构、变异效应预测（VEP）、跨物种同源基因、序列获取。
biomart
Ensembl BioMart 批量查询：基因 ID 互转、转录本清单、染色体区间取基因、跨物种同源、GO 注释。
variants
变异解读：gnomAD 群体等位频率（含祖源分层）与基因约束指标，以及 ClinVar 临床致病性分类。
gwas
GWAS Catalog 关联查询：按变异查性状与效应量、按基因查区域关联变异、按性状解析本体 ID。
civic
CIViC 临床变异证据：查基因变异、可行动证据（类型/等级/意义/疾病/药物），或反查药物证据支持。
expression
基因组织表达（GTEx）：查基因在 54 个人体组织中的中位表达量并出图，或横向比较多个基因。
rna
非编码 RNA 检索与解读：RNAcentral 全文检索与序列、R2DT 二级结构、跨库交叉引用、Rfam 家族。
omics
公共组学数据检索：GEO 表达数据集、BioStudies/ArrayExpress 研究、PRIDE 蛋白组项目。
seqdata
ENA 公共测序数据检索：按 accession 或关键词查三级元数据，并生成 nf-core samplesheet。
singlecell
CZ CELLxGENE Discover（2000+ 数据集、约 2.85 亿细胞）：按组织/细胞类型/疾病找数据集。
蛋白与结构
uniprot
UniProtKB 蛋白条目：功能、结构域与位点、序列（FASTA）、已有 PDB 结构清单。
proteinreport
结构化蛋白报告：AlphaFold 预测结构、Pfam 结构域、ClinVar 致病变异聚合、致癌热点标注。
alphafold
AlphaFold DB 预测结构（2 亿+ 条）：三维结构、逐残基 pLDDT、AlphaMissense 致病性预测。
fold
把氨基酸序列折叠成三维结构（ESMFold，400 aa 内），并与参照骨架做最优叠合比较。
rcsb
检索并下载 PDB 结构：全文检索、按序列找同源、条目元信息（方法/分辨率/链/配体）。
esm2GPU
ESM-2 蛋白序列表征与逐位点伪困惑度，可用于变异效应初筛。
proteinmpnnGPU
给定蛋白主链结构（PDB），反向设计能折叠成该结构的氨基酸序列。序列不出容器。
ligandmpnnGPU
考虑配体/辅因子/金属离子环境的反向序列设计。纯本地推理，序列不出容器。
solublempnnGPU
反向设计偏向可溶性表达的序列。纯本地推理，序列不出容器。
药物与临床
compounds
ChEMBL 化合物与活性：分子性质与类药性（Ro5）、PubChem 计算性质、按靶点列效价最高化合物。
pharmacology
IUPHAR/BPS 靶点-配体药理数据：配体结构与获批状态、带亲和力的相互作用清单、靶点家族。
indication
给定药物靶点，汇总关联疾病（Open Targets 证据评分）与近期文献，生成适应症调研档案。
trials
ClinicalTrials.gov 试验检索：按适应症/干预/状态/期别筛选，按适应症汇总研发格局。
fda
openFDA 监管数据：Drugs@FDA 审批申请、说明书关键段落、按药理类别统计同类药物。
cancermodels
cBioPortal 癌症基因组队列：检索队列、查基因突变谱与高频蛋白改变（含分布图）。
tcga
NCI GDC 拉 TCGA 队列临床生存数据：生存时间/事件/性别/诊断年龄，直接可画 KM 曲线。
分析与生成
python
离线容器执行任意 Python：numpy/pandas/matplotlib/scipy 预装，中文标签开箱可用，代码与输出留档。
bionemo
NVIDIA BioNeMo 生成式模型：Evo 2 序列续写、Boltz-2 共折叠与亲和力、OpenFold3 结构预测。
scviGPU
scvi-tools/scanpy 单细胞质控、UMAP 嵌入、标志基因气泡图、批次校正与差异表达。
kg
实体关系落成标准图谱文件（.graph.json）：前端可交互，可并入租户级总图长期积累。
写作、绘图与排版
plot
出版级绘图：柱状/折线/散点/箱线/热图/火山图/KM 生存曲线/森林图/多面板组合图，SVG 矢量投稿可用。
office
Word 报告、PPT 演示、Excel 数据表直接生成，文件落工作区可下载、可版本化。
typeset
Typst 源码编译 PDF（默认排版引擎）：双栏版式、内嵌图，亚秒级编译。
texset
LaTeX（xelatex + latexmk）编译 PDF，投稿要 .tex 源文件时使用。
权威数据源 · 30+
AlphaFold DB
2 亿+ 蛋白预测结构与置信度
工具与安全
Reviewer · 独立复核
交付前由另一个模型核对数值、标识符与原文一致性；发现 major 问题自动触发修正并公开标注。
Sandbox · 沙箱执行
每个技能运行在独立容器：非 root、只读根文件系统、默认断网、出网仅限白名单域名。
Approval · 审批账本
敏感动作分三类授权（一次 / 本会话 / 一直），审批超时默认拒绝，账本可查可吊销。
Notebook · 过程留档
全部 Python 代码单元按执行顺序留档（代码 + 完整输出），是复盘分析过程的最佳入口。
Versions · 版本链
同名产物重跑形成 v1/v2…版本链，可对比、可按版本下载。
Memory · 长期记忆
研究方向与常用约定写成记忆笔记，跨会话自动带上；随存随删，由你管理。